胃咕咕叫考虑与生理因素、病理性的因素有关系。
胃咕咕叫有可能长时间没有进食，胃内过度空虚饥饿，导致胃内咕咕叫，这属于正常的，进食后这种症状可以消失。也有可能胃部的疾病引起，比较常见的是慢性胃炎、胃溃疡、胃部的肿瘤。由于胃的黏膜受到损伤，胃的消化能力下降，排空能力较慢，从而导致食物在胃中产生气体，引起肚子咕咕叫。
也可能是消化不良，由于消化酶分泌缺乏，食物在胃中得不到完全的消化，分解产生不良的发酵，有较多的气体产生，胃肠运动时产生咕咕叫。