小儿脑膜炎的检查方式包括血化验，比如血常规，炎症指标中的C-反应蛋白、血沉、降钙素原以及常见的呼吸道病原检测。除此以外，需进行脑电图以及头颅核磁影像学的检查，以了解脑膜炎是否合并有并发症以及病情轻重程度。
因为脑膜炎大致分为细菌性、病毒性、结核性以及真菌性四类。具体的分型需根据腰穿、脑脊液的检查明确诊断，必要时可行脑脊液的细菌学培养，以及脑脊液的细菌学涂片检查，明确病原后采取针对性的治疗。
腰椎穿刺术是脑膜炎诊断的金标准，一旦确诊后需尽快对症治疗。