手足口和病毒疹的区别主要在于感染病原微生物不同。
手足口属于特定疾病，其感染病原微生物主要为手足口病相关病毒。病毒疹并不是单一疾病，而是一组病毒感染后导致皮疹的疾病统称，其包括的范围相对较广，病原微生物种类较多，手足口病就属于病毒疹的一个分型。
在临床工作中，如发现患者皮肤、口角、肛周等位置出现典型病毒皮疹症状，可诊断为病毒疹，进一步需进行病毒种类检测，如考虑为手足口病相关病毒感染，进一步可以诊断为手足口病。