心肌炎的预后取决于心肌炎的临床症状、严重程度，是否发生了严重并发症，以及治疗措施是否及时、有效等多种原因。部分急性心肌炎的患者临床可以没有明显的症状，大部分患者预后非常好。
急性心肌炎的患者病程可以在2~4周，通过有效地治疗可以得到有效的治愈。部分患者由于病情严重，治疗不及时，可以转为慢性心肌炎。
如果是暴发性心肌炎，在急性期可以合并严重的心力衰竭、严重的心律失常，可以诱发心源性休克，甚至导致患者的死亡。