发现癌胚抗原高以后需要根据不同的原因给予处理。
首先，要确定造成这项指标升高的原因。对于疾病引起的升高，例如一些患有恶性肿瘤患者的癌胚抗原高于正常值，需要对于这些恶性肿瘤进行确诊以及临床分期的判定，根据不同分期的治疗原则，采取手术、放疗、化疗等抗肿瘤治疗。
如果癌胚抗原指标的升高是由于一些炎性疾病导致，治疗上需要给予抗炎治疗后再复查癌胚抗原了解指标的降低情况。如果癌胚抗原升高并非由于疾病因素，而是由于长期吸烟，或者是由于妊娠的因素，应该戒烟，然后定期观察这项指标不需要给予特殊的处理。