直肠炎的治疗主要就是以肛门的局部用药为主。
1.可以使用中药进行保留灌肠，可以自拟中药方剂。另外，也可以使用康复新液，或者是复方黄柏液涂剂进行保留灌肠，主要的目的就是修复受损伤的直肠黏膜组织。另外就是配合药膏和药栓肛管直肠内给药。
2.属于溃疡性直肠炎的患者，需要使用5-氨基水杨酸制剂进行对症的治疗。
3.对于急性期的患者，比如黏液脓血便症状明显的，可以使用糖皮质激素成分的药物进行对症的治疗。如果有发生腹泻、大便次数增多的，也要合理地使用止泻的药物进行对症的治疗。