手指甲有黑线是什么疾病，要依据局部的症状进行具体分析。
如果手指甲上的黑线是非常细小的黑线，指甲表面没有任何改变，而且在出现黑线之前有过被外界刺激挤压的历史，考虑为甲下线状出血。应该是外界刺激，引发指甲下方毛细血管破裂，从而使某些血管内部的血液在甲下淤积，从而形成的黑色竖线。
如果这种黑色竖线颜色并不是特别深，从指甲根部直达指甲尖端，考虑则为指甲部位的营养不良，可能与微量元素缺乏有一定程度的关系。