肛周脓肿已经溃破、流脓也还是需要通过手术进行治疗。肛周脓肿在发生溃破以后，就会形成肛瘘的状态。肛周脓肿和肛瘘是属于同一个疾病的两个过程，都是属于感染化脓性的疾病，也都需要通过手术进行治疗。
单纯地通过药物治疗起不到根本性治疗的作用，容易反复地出现临床症状。肛周脓肿在发生溃破，流脓以后，还是要及早地进行根治性的手术。如果是低位的，可以进行直接切除的方式治疗。
如果是高位、复杂的，一般是采用挂线的手术方式，主要的目的就是最大程度上保护肛门括约肌的功能，保持手术创面引流的通畅，可以避免在手术以后出现肛门失禁，也可以降低复发的几率。