下消化道出血最常见的部位第一个来自于小肠和结肠直肠出血。 对于小肠出血诊断方面，可以选择性肠系膜上动脉造影、CT及术中内镜检查可能对小肠出血病变做出定位的诊断。X线钡餐检查对于定位诊断也有一定的帮助。另外经口吞入末端系适当重物的细塑胶管，导管随胃肠蠕动逐步向小肠推进，一旦自塑料管抽得血液，即可经塑胶管注入造影剂做小肠造影，有助于出血病变的定位。而对于结肠直肠出血检查方面，如果持续活动性出血，肠系膜动脉造影检查常常可以发现出血来自结肠。憩室或者其他出血性疾病，也可同时行靶血管栓塞治疗。在出血间歇期，聚乙二醇通便后行纤维结肠镜检查，诊断符合率有时可达70%。也可同时经内镜治疗。
但当结肠有活动性出血时，影响结肠镜的视野，因此内镜检查没有诊断价值。钡剂灌肠检查，对于憩室病、肿瘤的诊断有重要意义。放射性核素扫描的敏感性和特异性目前还存在争论。