透析是治疗尿毒症的主要方法。另外，还需要应用控制血压、纠正贫血以及钙磷失调的药物，针对并发症进行治疗。
尿毒症患者的肾功能基本丧失，由于毒素的大量蓄积，会导致出现一系列严重的并发症，患者会出现肾性贫血和肾性骨病。需要应用铁剂、促红细胞生成素等药物纠正贫血。需要口服钙剂、骨化醇等药物治疗肾性骨病。应用降压药物控制血压，临床上常用的主要是钙离子拮抗剂。
患者会出现严重的水肿，还需要应用利尿的药物减轻心肺等器官的负担。需要应用降血脂、血糖、保护血管的药物进行治疗。