龟头发胀疼多半和包皮过长或者包茎，使龟头充血压迫龟头神经有关。
如果存在包皮过长或者包茎，会影响龟头的正常翻出，这种情况下需要面诊医师，然后选择手术的方法治疗。另外龟头发胀疼，还和病原微生物刺激龟头和尿道口有关，例如尿道口炎龟头炎人群，就会出现明显的龟头发胀、疼痛现象。
此时会伴随着尿道口分泌物或者龟头冠状沟处出现大量包皮垢，建议清理干净龟头和尿道口部位，然后涂抹酮康唑乳膏消炎治疗。