PET-CT相对十分安全，是通过注射18F-FDG这种药物来显影，它作为葡萄糖类似物，是临床上应用最多的肿瘤代谢显像剂，这种药物虽然有一定的辐射性。
但是，每个人注射的药物都是按照公斤、体重计算药量，并且这种药物都有一个半衰期，通常在30分钟到两个小时之内就能够衰变，对自己、对周围的亲友都很安全。
通常一次PET-CT全身检查的辐射量也就相当于二到三次的常规ct检查。因此，不必要为PET-CT检查的安全性担忧。