甲沟炎在早期可以外用莫匹罗星软膏、鱼石脂软膏等药物进行治疗，能够起到消炎、防腐、消肿的作用，改善不适症状。
当存在细菌感染时，应当使用抗生素类软膏治疗，比如克林霉素软膏、红霉素软膏等，能够起到抑菌和杀菌的作用。
如果继发了真菌感染，还应当配合使用抗真菌的软膏治疗，比如克霉唑软膏、氟康唑软膏等，能够抑制和杀灭真菌。
在治疗的过程中也要做好患处的护理，避免患处受到过度挤压，保持清洁与干燥，在修剪指甲时要小心，避免对周围的皮肤造成损伤。