发生尿道结石时多数情况下结石的体积都是大于尿道管径。因为体积小于尿道管径的结石常会随着尿液排出体外。此时需要予以对症治疗才能将结石排出，治疗方法的选择需要结合结石的大小及所处的部位决定。
如果结石体积略大，但可以在尿道镜下推动，此时若结石距离膀胱开口较近，可将结石推入到膀胱内，再行体外冲击波碎石治疗，将结石破碎后排出。若结石距离尿道口较近，可在扩张尿道后将结石钳出。
如果尿道结石体积很大，嵌顿在尿道内难以移动，则需行尿道切开取石手术治疗，术后需要留置导尿管，防止尿道狭窄的发生。