怀孕初期有褐色的分泌物，需要到医院行进一步的检查和处理。
首先需要根据怀孕的周数来决定行选HCG的检查，还是行超声的检查。如果怀孕已经超过了六周，一般就可以行超声的检查，如果超声提示了宫内的早孕甚至有胚芽的搏动，就可以考虑是先兆的流产引起，一般就可以予以保胎处理。
如果宫内没有孕囊就需要考虑是宫外孕引起，一般还需要行血HCG的检查。如果血HCG上升的比较慢，同时如果再次行超声复查，提示宫外有包块就需要积极的处理，要避免宫外孕发生大出血的可能。
对于在怀孕初期有褐色的分泌物，还需要行妇科的检查，需要排除是因为阴道的炎症或者是宫颈的炎症，导致的褐色分泌物就需要予以局部用药或者是抗炎等处理。因此对于怀孕初期出现褐色的分泌物是属于一种异常的情况，需要予以处理。