肛瘘在手术之前需要做体检，了解患者肛瘘的位置、内口的位置，是单纯性的肛瘘还是复杂性的肛瘘。比如可以做肛瘘造影，通过在外口中间注入一些造影剂，在X线下进行观察，可以了解患者肛瘘的走行、瘘管的数目。
另外，也可以做核磁共振也可以判断肛瘘的走行等情况。
在肛瘘明确诊断以后，还需要结合其他的一些术前检查，比如胸部平片、心电图、盆腔CT。同时还需要抽血检查，了解患者血常规、生化常规、凝血常规等指标。