试管移植失败的原因主要有以下几点：一、胚胎质量差，胚胎发育潜能不好，移植入子宫腔后不能正常着床或者是着床后不能继续分裂发育，所以移植失败。
第二点子宫内膜容受性不好，宫腔内的环境不利于胚胎着床。子宫内膜薄，子宫内膜的形态欠佳。这两点是试管婴儿移植失败的最主要原因。胚胎的发育潜能，相比来说，囊胚比第3天胚胎要好，所以囊胚着床率略高一些。
此外，年龄也是一个关键因素，高龄患者移植失败率比较高，尤其是40岁以上的人群。而年轻患者移植后成功率比较高。还有一个影响因素，就是患有子宫内膜异位症的人，妊娠率也会大大降低。