Barrett食管微创手术后，有可能会引起局部狭窄或者是疤痕组织增生。目前微创手术创伤比较小，恢复比较快，大部分手术比较顺利的情况下，一般不会有后遗症出现。
Barrett食管的症状主要是胃食管反流及并发症所引起，一般为食管反流，症状为胸骨后烧灼感、胸痛及反酸。临床出现典型烧心及反酸后去就诊，部分患者也会因食管狭窄或者癌变，出现吞咽困难为就诊症状。
Barrett食管微创手术后，也需要定期进行胃镜复查，观察试管愈合情况，除外，还需要多注意养成良好的饮食及生活习惯。