预防脑血栓后遗症，关键是在脑血栓发病的早期积极治疗，使血栓被溶解、堵塞的血管再次开通，挽救即将缺血、坏死的脑细胞。
脑血栓的后遗症都是因为大脑细胞缺血坏死后，对身体某部分的功能失去了控制所导致的，所以在疾病的急性期，治疗越及时越有效，能够存活的脑细胞越多，脑血栓的后遗症就会越轻。当然在疾病后期继续康复治疗和服药治疗也是很重要的，有一些抗血栓的药物可能需要长期服用。
在平时的生活中还要控制好高血压、糖尿病等合并症。注意清淡饮食，避免过度的熬夜、劳累，以免加重了脑血管的损伤，导致脑血栓的再次发作。