对于病情较轻的脑积水通常选用药物疗法，也就是非手术疗法。如果脑积水比较严重，非手术治疗效果不佳，可选用手术疗法。
非手术疗法主要是通过药物来控制脑积水的发展，主要应用利尿剂或脱水剂，比如甘露醇、速尿等。对于脑积水内压力比较高或非手术疗法失败的患者，可采用手术疗法。手术疗法包括病因治疗，主要是通过手术解除梗阻，还可使用脑脊液分流术，使用引流管将多余的脑脊液分流至腹腔，在手术后也要加强对患者的护理。
脑积水疾病通过药物疗法与手术疗法可治愈，术后症状会明显的好转，但也有部分患者会留有并发症。