脑干软化灶意思是指脑干这个部位出现了一些软化病灶。它导致的原因有很多种：
有些是因为脑干的血管病变，比如脑干梗塞或者脑干出血，好转以后脑组织有坏死，形成了软化灶所导致的。
还有一些患者可能因为外伤引起脑干损害，到了后期也会形成脑干的软化灶。
还有一些有可能是原因不明或者先天性的因素所导致。比较小的脑干软化灶对于人体的影响不大，患者基本上没有什么不舒服的现象。如果大面积的脑干软化灶，就会影响脑干的功能，会出现一些神经功能障碍的症状。严重的情况下，还有可能会导致患者出现意识障碍，出现神志不清的现象。