小儿半夜咳嗽大多数会有食管、气管反流，还有一些是过敏性的咳嗽所导致的。因此，半夜的咳嗽用什么药来治疗，要针对什么原因引起的咳嗽才可以进行。
孩子一定要去医院就诊，经过医生的诊断确定。如果是食管、气管反流引起的半夜咳嗽，晚餐的时候就要减少进食的量，可以用一些消化道的动力药促进消化道蠕动，减轻食管、气管反流。
如果是过敏性的咳嗽引起的，比方咳嗽变异性哮喘、支气管哮喘这一类的疾病，则按照哮喘的管理方法给予抗过敏和止咳的药物治疗。