临床上低血糖症和低血糖反应的区别主要有以下几点：
第一，血糖值不同。低血糖症患者血糖低于2.8mmol/L，低血糖反应患者往往为正常血糖水平。
第二，临床症状不同。低血糖症患者因为血糖低于2.8mmol/L，往往症状较重，可表现为心慌、出汗、乏力、视物模糊，严重者可出现意识恍惚、昏迷；低血糖反应患者因为血糖下降幅度过快，引起交感神经兴奋的临床症状，往往症状较轻。
第三，发病的原因不同。低血糖症常见的原因为药物性低血糖，Ⅱ型糖尿病患者口服药物剂量过大，还见于胰岛B细胞瘤、腺垂体功能减退以及胃大部切除术后的患者。
低血糖反应往往见于糖尿病患者在降糖治疗过程中，因为血糖下降幅度过大，而引起低血糖反应。