就目前的医疗水平和医疗手段来看，该类疾病的手术风险并不大，因为对侧肾积水是因为病情的进展到了终末阶段，由于输尿管口出现狭窄、输尿管口关闭不全、膀胱的挛缩、输尿管下端狭窄等原因，造成的尿液排流不畅、尿液反流，从而引起对侧肾积水。
一般在手术之前，患者服用抗结核药物两周以上，然后切除患侧肾脏，在情况好转以后，再处理积水。
如果病情较重者，要先造瘘处理积水，再切除肾脏，具体情况和风险，患者要与自己的主治医生沟通了解情况。在进行这种手术之前要进行签字同意书，告知可能出现的各种风险与利弊。