手上长小水疱很痒是不能用手挠的，以免因抓挠而抓破水疱引起感染，不利于病情恢复。可以针对病因给予对症治疗，改善长水疱痒的症状。
如果是水疱在手指皮肤表浅处，呈粟粒大小，并以对称形式出现，考虑是湿疹。可以涂抹炉甘石洗剂，既能促进水疱自行干燥，又有止痒作用，或者服用西替利嗪缓解瘙痒症状。水疱吸收后出现脱皮时，可涂抹糖皮质激素类药膏，比如莫米松软膏等进行治疗。
如果水疱是在皮肤深处出现，疱壁厚，同时手爱出汗，考虑是汗疱疹。也可以涂抹炉甘石洗剂，服用抗组胺药物，比如氯雷他定等，缓解痒的症状。水疱干后，也要用糖皮质激素类的药物治疗，比如曲安奈德软膏进行治疗。
如果是一只手长水疱，有的水疱破裂后手部皮肤角化过度增厚，考虑是手癣。要外用和内服抗真菌药进行治疗，才能彻底改善手上长小水疱痒的症状。