肛门疣经过规范科学的治疗后，是可以治愈的。
肛门疣是一种病毒感染，根据感染病毒的不同，其临床表现有所不同。常见的有扁平疣、丝状疣，这种类型的疣可以在全身各个部位发病。通常传染性很低或者无传染性，治疗时在切除疣体的同时，要进行适当的抗病毒治疗。尖锐湿疣是一种性传播疾病，好发于肛门等潮湿的部位，应及时的治疗，防止传播给他人。
肛门扁平湿疣通常继发于梅毒感染之后，也是具有较强的传染性。不管哪种类型的肛门疣，只要经过规范的治疗，是可以治愈的。