碘131治疗甲亢的原理，主要是通过碘放射性射线破坏甲状腺组织，减少甲状腺激素的合成，以及释放而发挥治疗的作用。因此碘131用量过大时有可能会引起甲状腺功能减退。
在行碘131治疗甲亢前一周必须要停用抗甲状腺的药物。因为抗甲状腺药物会影响碘131治疗甲亢的效果。碘131的射线很短，一般只聚集于甲状腺组织，而不会影响到其他组织，所以相对而言也还是十分安全的。
但是对于一些年纪十分小的一下婴幼儿。还是要保持一定的隔离状态。并且做碘131术后，所有的患者都必须要进行短时间内的一个避孕，在辐射完全消退后，才方可怀孕。