龟头里有小疙瘩，考虑与包皮龟头炎、珍珠样丘疹、尖锐湿疣等原因有关。如果龟头局部出现红肿、疼痛，发生糜烂，考虑是包皮龟头炎的可能性比较大。
大多是因为包皮过长，包茎的男性没有及时清理包皮垢，滋养了大量细菌，致病菌对龟头部位造成刺激引起感染，形成凸起的小疙瘩。
珍珠样丘疹也可出现冠状沟周围有米粒大小的小疙瘩，一般没有临床症状，不用特殊治疗。感染了人乳头瘤病毒形成尖锐湿疣，在龟头表面可形成小疙瘩，随着病情进展会越来越多，形成菜花状凸起，需要给予抗病毒治疗，同时需要夫妻之间互相治疗。