在临床上一般针对局部有糜烂或者溃疡形成，临床症状比较明显的直肠炎患者需要采取灌肠治疗。例如患者大便次数比较多或者有腹泻症状明显，并伴有黏液便、黏液血便甚至黏液脓血便时，需要采取灌肠治疗。
灌肠可以将治疗的药物直接灌入直肠内，从而对直肠炎起到治疗作用，而且对于直肠炎采取灌肠治疗效果比较好，副作用少。在临床上灌肠治疗的药物比较多，常用的有中药锡类散、溃疡散等。
对于溃疡性直肠炎的患者，也可以采取美沙拉嗪灌肠液灌肠治疗，具体的用药患者需要在专业医生的指导下使用。