防风通圣丸的药性相对寒凉，其中的栀子、大黄、石膏等药物有清热寒凉的药性，所以其主要的副作用为，可引起腹泻、腹胀。如果患者本身的脾胃不壮或有脾胃失和情况，服用本品更易出现这类不良反应。特别是脾胃虚寒，容易有便溏腹泻，需要禁止服用本药物。
防风通圣丸是由防风、大黄、荆芥穗、麻黄、栀子、薄荷等中药组成的一种具有解表通里、清热解毒的中成药物，即对于外寒内热、恶寒壮热以及表里俱实所致的头痛咽干、大便干结、小便短赤等这类症状的治疗有不错的效果。
但由于本品组方中的中药成分较多，患者在服用期间需要多注意，如果有任何异常症状，都需要及时停药就诊咨询医生。