融合肾可以通过手术分离。融合肾是肾脏先天性的发育异常，两侧肾脏没有独立发育，两侧肾脏融合在一起。但是融合肾的融合程度及方式多种多样，有些肾脏是下极融合在一起，比如马蹄形肾。
部分患者可以通过手术的方式进行分离。手术分离主要适合于双侧肾脏融合较少，相对独立，且输尿管没有严重畸形的患者。
手术前要仔细检查，尤其是要进行泌尿系统的造影检查，充分进行病情评估，制定好手术分离的方案。同时还要对输尿管进行处理。