宝宝出现发烧、拉肚子的情况，应该完善大便常规、大便病毒抗体，甚至大便培养等一系列检查明确病因。如果是病毒性感染引起的急性胃肠炎，可以通过口服补液或静脉输液的途径，纠正体液丢失的情况，可以口服调节胃肠道的益生菌，如乳酸杆菌、蜡样芽孢杆菌等，可以口服肠道收敛剂，如蒙脱石散等。
如果是细菌性感染引起的，则需要在专业医生的情况指导下，根据大便培养及药敏试验，适当选用药物敏感的抗生素抗感染治疗。胃肠炎最重要的急性并发症为脱水和电解质紊乱，需要给予积极处理。