甲状舌管囊肿和甲状腺有密切关系：
1.从组织学发生上，甲状舌管囊肿是一种先天性的囊肿，来源就是形成甲状腺的甲状舌管的残余上皮，没有完全退化最终残留形成的。所以从组织学发生上，甲状舌管囊肿和甲状腺就是密切相关的。
2.从发病的部位上，甲状舌管囊肿一般是在颈前部正中线，在舌骨和甲状软骨之间，也就是上面跟舌骨相连，下面跟甲状软骨有一定的关系，旁边就是甲状腺，所以从解剖学的位置上，是在甲状腺上方。
3.在手术治疗的时候，甲状舌管囊肿的典型治疗方法就是手术切除。但在手术之前一定要通过核素检查、B超检查等手段，来证实正常甲状腺是存在的、功能良好的。目的是对甲状舌管囊肿和异位甲状腺进行鉴别诊断。如果误将因为甲状腺当作甲状舌管囊肿切除了，将来会引起甲状腺功能的低下，影响患者的生活质量。
所以从以上可以看到，甲状舌管囊肿不管是从组织学发生、临床发病的症状，和手术治疗等诸多方面，都跟甲状腺有十分密切的关系。