在做动态心电图时发现心率变异情况，提示迷走神经的功能是否完好，从而反映自主神经系统的功能是否正常。
心率变异性大提示迷走神经功能完好，当迷走神经功能障碍时心率变异性变小，是一个判断和诊断心血管疾病的一个重要的指标，能够有效预防心律失常导致的心脏性猝死发生。
同时也可以诊断很多心脏疾病，如心肌梗塞、心律失常等，在这些疾病中病人的心率变异性降低。心率变异性可以判断窦房结频率是否正常，从而判断是否有相应的心脏疾病。