奥美拉唑肠溶胶囊早上起床后空腹服用，或者是晚上睡觉前半小时服用。
奥美拉唑肠溶胶囊是临床上常用的质子泵抑制剂，可用于胃、十二指肠溃疡、反流性食管炎，以及卓艾综合征的治疗。另外，可以预防应激性溃疡，如长期剂量较大使用糖皮质激素等。
需要提醒如果长期使用奥美拉唑肠溶胶囊等质子泵抑制剂，需要预防骨折的发生，以及维生素B12的缺乏。由于是肠溶胶囊，服用时注意不要嚼碎，要整粒吞服，以免药物在胃内过早释放影响疗效。
同时要注意，与奥美拉唑肠溶胶囊联合使用其他药物时，注意相互作用的可能性。如奥美拉唑肠溶胶囊与氯吡格雷联合使用时，就会影响氯吡格雷代谢活性产物，从而影响其抗血小板聚集的作用，所以这两个药物使用时应该间隔12小时。