腭咽闭合不全的存在，有可能会造成吞咽的时候，口腔中的食物反流进入鼻腔，尤其是吃流质食物的时候，往往会更加明显。
此外，因为咽鼓管不可以正常开放，有可能会引起耳闷、阻塞感以及听力下降等并发症。同时，腭咽闭合不全的后果还会影响发音。
对于腭咽闭合不全，需要先到口腔科接受相关方面的检查，找到了诱发因素才可以对因治疗。如果病情不严重，可以通过软腭活动训练以及语音训练来增加软腭运动，可以有效缓解病情。如果病情比较严重，就需要接受手术治疗。