小脚趾甲两瓣可能是发生了甲的真菌感染的情况，最常见的是灰指甲。
出现灰指甲会出现甲板的增厚，同时伴有脚癣、瘙痒、水疱形成。治疗一般是给予抗真菌软膏局部应用及口服抗真菌药物，或者应用中药进行调理、泡脚。口服抗真菌药物时应该注意监测肝功能、肾功能，治疗效果令人满意。如果治疗效果不佳，也可以行拔甲术。
另外，很多小儿出生之后就可见这种现象，这属于先天因素，不会对身体有任何影响，不需要过分担心，也无需任何治疗，所以需要注意和重视。