精囊脓肿与精囊囊肿的不同可以从发生机制、症状及治疗等几个方面来分析。
首先，两种疾病的发生机制不同。精囊脓肿是感染性疾病，是由于细菌感染引起的化脓性病变，脓肿内容物为脓液，临床上以大肠埃希菌感染较为多见；而精囊囊肿是遗传性因素或输精管梗阻等原因导致的精囊囊性扩张，其内容物是液体而无细菌感染。
症状上，精囊脓肿可有畏寒、发热、会阴部疼痛、血精等临床表现；而精囊囊肿病情较轻时常无明显症状，严重时可有会阴部胀痛不适。
治疗上，精囊脓肿需选择敏感抗生素抗感染治疗；而精囊囊肿较小时可无需治疗，定期复查即可，较大的囊肿产生压迫症状时，可行穿刺抽出液体治疗，建议到泌尿外科就诊，明确诊断后予以针对性治疗。