临床上不能根据CA125数值的高低，来判断癌症的存在。
这是因为虽然CA125属于癌症的一项肿瘤标志物，在很多癌症患者中，可以发现指标的数值异常升高，但是这项指标的升高，并非只见于癌症患者，也见于其他的一些非癌症的疾病。例如卵巢囊肿、大量的腹腔积液等。
在癌症的诊断中，CA125只起辅助作用，并不能依据指标升高的具体数值就判定癌症的存在，还需要结合其他影像学和病理学的结果，才能综合地对癌症疾病做出诊断。