肠道息肉有部分是会发生癌变的，而且有的肠道息肉的癌变率还是很高的。例如绒毛状腺瘤性息肉、管状腺瘤性息肉，都属于癌变率相对较高的肠道息肉。
数据报道绒毛状腺瘤息肉的癌变率可以达到50%，对于肠道息肉还没有发生癌变的良性疾病，一般临床上需要给予肠镜下的息肉摘除或切除手术。然后每年定期复查肠镜，发现息肉就需要给予摘除或切除治疗。
而对于肠道息肉发生癌变后形成的恶性肿瘤疾病，需要评估癌变后的肠道息肉的临床分期情况，然后依据不同分期采取不同的治疗策略，常用的有手术治疗、放疗、化疗、靶向等多种治疗措施。