男生上完厕所后阴茎有刺痛感可通过注意生活习惯、物理治疗、药物治疗等方式缓解。
1.注意生活习惯。避免吃辛辣、刺激性的食物，例如辣椒、大蒜等，应该清淡饮食。平时避免劳累、熬夜，少吸烟、饮酒，多喝水，勤排尿。保持个人清洁卫生，内裤每天更换，并单独清洗。
2.物理治疗。如果检查存在碎石，则根据碎石的大小和部位可进行冲击波碎石。如果检查皮肤有红肿和溃烂等情况，可给予清洁换药，消毒等处理。
3.药物治疗。如果尿常规可见白细胞和白细胞酯酶升高，可考虑泌尿系感染，可口服抗感染类药物，例如左氧氟沙星等药物。如果是衣原体和支原体感染引起的尿道炎，可口服多西环素或阿奇霉素进行治疗。