婴儿化验大便时，要尽量采取婴儿晨起的第一次大便，并在婴儿排便时要避免使用尿不湿，尽量将大便排到干净的玻璃器皿或塑料器皿上，以免纸尿裤的杂质对化验结果造成影响，并且纸尿裤容易吸附黏液以及细胞，此时大便无法准确地反映婴儿的状态。
若只能通过纸尿裤取样大便，则要尽快将纸尿裤上的大便转移到塑料容器中，并在1小时内送到医院进行检查。
大便取样时无需量过多，成型的大便在黄豆大小左右，而水样便则在1ml左右，取大便时还要避免大便沾到尿液。