百日咳和肺结核是不一样的。百日咳是由于百日咳杆菌感染导致的一种呼吸道的疾病，而肺结核是结核分枝杆菌感染导致的肺部炎症性病变，这两种疾病感染的致病菌是完全不相同的，因此百日咳和肺结核是完全不同的两个疾病。
百日咳的患者和肺结核的患者临床表现也是不太相同的，百日咳的特征是剧烈的咳嗽。而肺结核的特征往往会是午后低热，夜间盗汗，还有可能会出现咳嗽、咳痰、咯血等相关的表现。
百日咳的患者胸部CT可能会是正常的，但是肺结核的患者胸部CT 往往会有相关的表现，肺结核的患者痰抗酸染色还可以表现为阳性。