如果是暂时性的单纯的窦性心动过速，是不会导致严重后果的，因此也不严重。如因为剧烈运动、精神紧张、情绪激动等引起的窦性心动过速，这时候窦性心动过速并不严重，很快就可以恢复。
如果由于自主神经功能紊乱导致的不适当的窦性心动过速，这种窦性心动过速就有可能造成严重的后果。长期的窦性心动过速可以引起心动过速性心肌病，导致心脏扩大、心功能下降，引起心力衰竭，需要积极的处理，必要时要给予β受体阻滞剂控制窦性心动过速。
临床上单纯性的窦性心动过速并不多见，大多是因为一些疾病的原因所引起。因此，要针对引起窦性心动过速的病因进行治疗。