尿尿刺痛的常见原因是患有尿路感染，充血水肿的尿道黏膜是引起刺痛感觉的疾病诱因，小便时尿液对尿道黏膜的炎性刺激可加重小便的刺痛感觉。
患有尿路结石也可导致刺痛感觉，跟结石对尿道机械性刺激有关。尿道口外力摩擦损伤，尿液排出时对损伤创面的污染，也可发生尿尿时刺痛感觉。
临床直观查看尿道口外观的性状，可明确排尿刺痛的损伤因素。可结合尿液常规化验检查，根据检查结果提示，可明确尿路感染导致的排尿刺痛，一般可给予吲哚美辛对症止痛，以及喹诺酮类药物进行抗炎治疗。