高烧不退一直咳嗽时会导致患者的病情加重，产生相应的并发症或后遗症，影响患者的预后。例如高烧不退一直咳嗽是由呼吸道细菌感染引起，此时随着肺部感染程度加重可形成重症肺炎，进而出现了肺脓肿、脓胸、脓毒血症、感染性休克等严重的并发症，患者病情难以缓解，严重者有可能因此继发多脏器的功能损害，甚至是有生命的危险。
如果是病毒性肺炎引起的高烧不退和一直咳嗽，有可能较快的继发急性呼吸窘迫综合征、呼吸衰竭等情况，患者需要呼吸机辅助支持治疗。
针对高烧不退一直咳嗽时，一定要积极的查明原因，若是感染性因素引起者，要早期选择敏感的抗感染药物，配合必要的对症处理来控制和缓解其病情。