部分有影响，部分可自愈，预后取决于缺损的大小。
室间隔缺损就是在左心室和右心室之间存在一个缺损，血液在收缩期就会由左心室进入右心室。缺损大小关系着以后的预后。对于胎儿室间隔缺损较小，一般直径2毫米以内，有一部分孩子随着室间隔发育会逐渐闭合达到自愈。有一部分孩子不能够发生自愈或者较大无法愈合，可以通过介入手术来封堵缺口。总之此类疾病治疗已比较成熟，不用过多担心。
随着胎儿围产医学的发展，很多胎儿在孕期通过做胎儿心脏超声，就可以发现有没有室间隔缺损存在。对于胎儿室间隔缺损，有一部分孩子随着室间隔发育会逐渐闭合达到自愈。因此只需要随诊，不要过于紧张。