隐匿性肾炎和IgA肾病虽然都是属于肾小球疾病，但是两者之间还是有很多区别。隐匿性肾炎是属于临床诊断，是肾小球疾病的临床分类，而IgA肾病是属于病理诊断，是指在肾小球的系膜区有以IgA为主的免疫球蛋白的沉积 。
通常隐匿性肾炎患者病理类型是多种多样的，其中包含有IgA肾病的病理类型，而IgA肾病患者如果表现只是有肉眼血尿或镜下血尿，伴有或者不伴尿蛋白的增多，如果患者的血压、肾功能是正常的，在这种情况下IgA肾病临床类型可以诊断为隐匿性肾小球肾炎。