对于有肾结石的患者，首先应该注意的是每天必须多喝水，通过多喝水来预防结石的增大，此外一些较小的肾结石可以随着尿液排出体外。
对于一些已知道成分的结石，应针对结石成分合理的调整饮食结构。对一些因代谢异常所导致的肾结石，可以针对原发性的疾病来治疗。对于没有症状，且没有导致一些并发症的肾结石，如果结石体积很小，可以选择保守治疗，定期观察即可。
如果肾结石引起了相应的临床症状，可以对症治疗。如果结石体积较大，可以选择手术治疗或者是体外冲击波碎石治疗。手术的方式可以选择输尿管软镜下碎石，或者是经皮肾镜碎石手术治疗。