肠炎可通过服用抗生素、止泻药物、微生态制剂来治疗效果较好。
肠炎多是由于细菌感染，所引起的。肠道出现炎症，引起肠道黏膜损伤，通常会表现为腹痛、腹泻等表现。如存在有细菌感染，可选择较为敏感的抗生素，进行抗炎治疗，常用的有庆大霉素、诺氟沙星等。如腹痛较严重的，可用止痛药物，比如阿托品、颠茄片。
同时要服用修复肠道黏膜的止泻药物，常用的有思密达、洛哌丁胺等。肠炎通常会导致肠道菌群紊乱，需补充培菲康、布拉氏酵母菌等，调节肠道的菌群。